注册公司缴税的种类有：流转税、所得税、资源税、财产税、行为税、其他税等。

一、个人所得税补交是个人还是公司交

个人所得税补交是由个人去交的。个人所得税顾名思意就是个人所得部分超过该税种起征点部分应缴纳的税额。因此，补缴个人所得税是个人行为。也就是说补缴个人所得税应由个人去缴纳。单位没有履行代扣代缴义务，只能进行处罚。个人所得税是月收入大于5000的人需要缴纳，工资越高，缴税越多。

二、设立分公司是否可独立核算？

1.分公司是不是独立核算由公司自由决定。

2.营业税或者增值税等流转税种在当地缴纳，但如果你公司跨地区设立了总分机构，所得税应当适用国税发(2008)28号文件，由总公司汇总计算，分公司按比例当地预交。

3.基于所得税汇总缴纳，你们肯定要汇总整个公司的报表，但是同时也要分开核算，能够区分分公司的收入，工资，资产(建议做总公司下面的部门核算单位)。

4.总公司收不收取管理费用仅是你们公司内部的利润分配计算方式，因所得税要汇总计算，不会对整个公司所得税产生影响。

5.总公司收取管理费用的分录建议做管理费用的内部冲销，或者挂其他应收应付等往来科目，总公司最好不要确定收入，否则又要多交一道流转税。