协议书在本质上也是合同的一种表现形式，只要内容符合法律规定，双方当事人有相应的民事行为能力，协议就有法律效力。如果是在签订合同后，双方又签订补充协议的，则补充协议视为对合同的修改和补充，协议是有效的，如果协议与合同有冲突的，则应以后签的协议为准。

一、劳动合同补充协议具有效吗

劳动合同关于劳动报酬补充协议是有效的。在双方自愿且符合法律规定的要求的，签订的补充协议，与劳动合同享有同等法律效力。合同补充协议是对原合同未尽事宜，或者合同履行过程新发生的情况而另外进行的约定。

根据《劳动合同法》第三十五条规定，用人单位与劳动者协商一致，可以变更劳动合同约定的内容。变更劳动合同，应当采用书面形式。

变更后的劳动合同文本由用人单位和劳动者各执一份。

二、同一标的签订两份合同如何处理

如果后一份合同是前一份合同内容的补充的话，往往将后一份合同认为是前一份合同的补充协议，此时，只要内容不冲突，那么两份合同都是有效的。如果有冲突的话，则一般是以后一份合同为准。原则上，在存在前后合同的情况下，都是要根据协议内容确定，一般以在后合同约定为准。

三、协议书生效后发现有问题可以改吗

依据相关法律的规定，已经生效的协议如果存在明显问题的，对一方利益造成侵害的，协议是可以依法撤销的。合同签订生效后是可以修改的，不过修改也是有条件的，必须交易的双方都同意修改合同才可以实现，一般来说，修改合同可以通过签订补充协议或者是解除原合同重新签订合同的方式来实现。