二手房阴阳合同的处理方法如下：

1、签订的两份合同不需要批准或者备案的，以实际履行的合同为准。一些法院的判例以后期的合同为准；

2、合同需要备案的，以备案合同为准，这是一般原则。但备案合同未实际履行，实际履行合同有违法利益的，价格以实际履行合同为准，其余按备案合同约定，备案合同未约定的，阴合同有相关内容按阴合同约定执行。

二手房阴阳合同提取公积金合法吗

二手房阴阳合同提取公积金显然是不合法的，属于欺诈的行为，构成诈骗罪，具体情况如下：

1、诈骗公私财物，也就是公积金，数额较大的，处三年以下有期徒刑、拘役或者管制，并处或者单处罚金；

2、数额巨大或者有其他严重情节的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金；

3、数额特别巨大或者有其他特别严重情节的，处十年以上有期徒刑或者无期徒刑，并处罚金或者没收财产。

4、以欺骗手段提取本人住房公积金账户内存储余额的职工，在全额退款2年之日起才可申请住房公积金贷款；情节严重的，在全额退款5年之日起才可申请住房公积金贷款，可贷额度不超过正常申请额度的50％；

5、住房贷款有累计逾期6期以上（含6期）记录的职工，在贷款结清2年之日起才可申请住房公积金贷款；情节严重的，在贷款结清5年之日起才可申请住房公积金贷款；

6、提供虚假资料骗取贷款的职工，公积金中心将保留不良诚信记录5年，期间不受理其住房公积金贷款申请；情节严重的，追究其法律责任。

《中华人民共和国民法典》第一百四十六条行为人与相对人以虚假的意思表示实施的民事法律行为无效。

以虚假的意思表示隐藏的民事法律行为的效力，依照有关法律规定处理。