违反交通信号灯通行扣6分，处二十元以上二百元以下罚款。

法律依据：《公安部关于修改的决定》已经公安部部长办公会议通过，自2016年4月1日起施行。其中道路交通安全违法行为记分分值规定如下：

道路交通安全违法行为记分分值

机动车驾驶人有下列违法行为之一，一次记6分：

(一)机动车驾驶证被暂扣期间驾驶机动车的；

(二)驾驶机动车违反道路交通信号灯通行的；

(三)驾驶营运客车(不包括公共汽车)、校车载人超过核定人数未达20%的，或者驾驶其他载客汽车载人超过核定人数20%以上的；

(四)驾驶中型以上载客载货汽车、校车、危险物品运输车辆在高速公路、城市快速路上行驶超过规定时速未达20%的；

(五)驾驶中型以上载客载货汽车、校车、危险物品运输车辆在高速公路、城市快速路以外的道路上行驶或者驾驶其他机动车行驶超过规定时速20%以上未达到50%的；

(六)驾驶货车载物超过核定载质量30%以上或者违反规定载客的；

(七)驾驶营运客车以外的机动车在高速公路车道内停车的；

(八)驾驶机动车在高速公路或者城市快速路上违法占用应急车道行驶的；

(九)低能见度气象条件下，驾驶机动车在高速公路上不按规定行驶的；

(十)驾驶机动车运载超限的不可解体的物品，未按指定的时间、路线、速度行驶或者未悬挂明显标志的；

(十一)驾驶机动车载运爆炸物品、易燃易爆化学物品以及剧毒、放射性等危险物品，未按指定的时间、路线、速度行驶或者未悬挂警示标志并采取必要的安全措施的；

(十二)以隐瞒、欺骗手段补领机动车驾驶证的；

(十三)连续驾驶中型以上载客汽车、危险物品运输车辆以外的机动车超过4小时未停车休息或者停车休息时间少于20分钟的；

(十四)驾驶机动车不按照规定避让校车的。

《中华人民共和国道路交通安全法》

第九十条机动车驾驶人违反道路交通安全法律、法规关于道路通行规定的，处警告或者二十元以上二百元以下罚款。本法另有规定的，依照规定处罚。