会扣分。机动车通过交叉路口，应当按照交通信号灯、交通标志、交通标线或者交通警察的指挥通过；通过没有交通信号灯、交通标志、交通标线或者交通警察指挥的交叉路口时，应当减速慢行，并让行人和优先通行的车辆先行。

骑摩托车闯红灯扣分吗？

不会直接扣分。电子眼拍闯红灯只能识别车辆牌照，并不能识别驾驶员，所以不会随便扣车主的驾照分，也许骑车的另有其人呢。这时候就要看去处理该违章的骑车人有什么驾驶证决定处罚情况了。两种情况：

1、骑摩托车的人有摩托车驾驶证，这时候和汽车驾驶证没有关系，各管各。摩托车违章就扣摩托车驾驶证的分。

2、骑摩托车的人没有摩托车驾驶证，只有汽车驾驶证；这时候就有关系了，属于准驾不符，汽车驾照会被扣12分。

《中华人民共和国道路交通安全法》第四十四条机动车通过交叉路口，应当按照交通信号灯、交通标志、交通标线或者交通警察的指挥通过；通过没有交通信号灯、交通标志、交通标线或者交通警察指挥的交叉路口时，应当减速慢行，并让行人和优先通行的车辆先行。