这里抵扣的是进项税额，燃油附加费也是你的支出，所以都可以扣。

一、工程发票丢了怎么办

一般纳税人丢失已开具专用发票的发票联和抵扣联，如果丢失前已认证相符的，购买方可凭销售方提供的相应专用发票记账联复印件及销售方主管税务机关出具的《丢失增值税专用发票已报税证明单》或《丢失货物运输业增值税专用发票已报税证明单》(以下统称《证明单》)，作为增值税进项税额的抵扣凭证；如果丢失前未认证的，购买方凭销售方提供的相应专用发票记账联复印件进行认证，认证相符的可凭专用发票记账联复印件及销售方主管税务机关出具的《证明单》，作为增值税进项税额的抵扣凭证。专用发票记账联复印件和《证明单》留存备查。

二、税务查出发票是假的怎么办

税务查出发票是造假，如果业务真实，但是发票开具有问题，建议与原业务提供方沟通，要求其重新开具合法发票。同时根据税务机关要求，是增值税专用发票的，做增值税进项税额转出处理。企业所得税不得作为税前扣除凭证。待取得合法发票后重新进行增值税进项税额抵扣和企业所得税税前扣除。

三、车辆通行费能抵税吗

车辆通行费能抵税。高速公路通行费可抵扣进项税额=高速公路通行费发票上注明的金额÷(1+3%)×3%；一级公路、二级公路、桥、闸通行费可抵扣进项税额=一级公路、二级公路、桥、闸通行费发票上注明的金额÷(1+5%)×5%。