双方婚后共同还贷支付的款项及其相应财产增值部分应根据财产的具体情况，照顾子女和女方权益的原则，由产权登记一方对另一方进行补偿。在原、被告签署的离婚协议中没有明确婚姻存续期间还贷部分及其相应财产增值部分如何分配，原告也未在离婚协议中明确放弃该部分财产，该部分财产属于未处理的共同财产，理应对原告就婚姻存续期间还贷部分及其相应财产增值部分予以补偿。

《民法典》第一千零八十七条【离婚时夫妻共同财产的处理】离婚时，夫妻的共同财产由双方协议处理；协议不成的，由人民法院根据财产的具体情况，按照照顾子女、女方和无过错方权益的原则判决。对夫或者妻在家庭土地承包经营中享有的权益等，应当依法予以保护。

第一千零八十九条【离婚时夫妻共同债务清偿】离婚时，夫妻共同债务应当共同偿还。共同财产不足清偿或者财产归各自所有的，由双方协议清偿；协议不成的，由人民法院判决。