婚姻关系不会自动解除。法律规定的离婚方式有协议离婚和诉讼离婚。协议离婚需要当事人之间协商一致，签订离婚协议书并进行登记；诉讼离婚中，如果夫妻是因为感情不和分居两年，能确定夫妻感情破裂的，可以向法院起诉离婚。

分居两年就可以自动解除婚姻关系了吗？

我们国家不存在自动离婚的说法，结婚需要依法登记，离婚也需要走法定程序。

想要离婚，如果没有去办理离婚登记或者经过诉讼，就算分居二十年你们的婚姻依然存在。

那么如果你因为感情不和，长期分居，但是对方还不配合办理离婚登记，可以按照以下步骤处理

第一，收集两人感情不和以及分居两年的事实证据；

第二，依据收集的证据到人民法院提起诉讼。

《中华人民共和国民法典》

第一千零七十六条夫妻双方自愿离婚的，应当签订书面离婚协议，并亲自到婚姻登记机关申请离婚登记。

离婚协议应当载明双方自愿离婚的意思表示和对子女抚养、财产以及债务处理等事项协商一致的意见。

第一千零七十九条夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民法院提起离婚诉讼。

人民法院审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。

有下列情形之一，调解无效的，应当准予离婚：

（一）重婚或者与他人同居；

（二）实施家庭暴力或者虐待、遗弃家庭成员；

（三）有赌博、吸毒等恶习屡教不改；

（四）因感情不和分居满二年；

（五）其他导致夫妻感情破裂的情形。

一方被宣告失踪，另一方提起离婚诉讼的，应当准予离婚。