公司股份回购程序如下：

1、符合公司回购股权的情形，符合条件的股东要求公司回购股份；

2、达成股权收购协议；

3、如不能达成协议，股东可以到人民法院提起诉讼。

根据《公司法》第七十四条第一款的规定，有下列情形之一的，对股东会该项决议投反对票的股东可以请求公司按照合理的价格收购其股权：

（一）公司连续五年不向股东分配利润，而公司该五年连续盈利，并且符合本法规定的分配利润条件的；

（二）公司合并、分立、转让主要财产的；

（三）公司章程规定的营业期限届满或者章程规定的其他解散事由出现，股东会会议通过决议修改章程使公司存续的。

公司股份回购有何不利影响

公司股份回购可能产生的不利之处有：有可能损害债权人的利益，对债权人而言，公司资本是债权设置及债权得以履行的基础，因股份回购而导致公司资本的减少可能直接使之受损。可能影响公司的财务结构、流动比率和资产负债率，从而可能进一步影响到继续扩大经营规模甚至威胁到公司的正常经营。

《公司法》第七十四条第一款

有下列情形之一的，对股东会该项决议投反对票的股东可以请求公司按照合理的价格收购其股权：

（一）公司连续五年不向股东分配利润，而公司该五年连续盈利，并且符合本法规定的分配利润条件的；

（二）公司合并、分立、转让主要财产的；

（三）公司章程规定的营业期限届满或者章程规定的其他解散事由出现，股东会会议通过决议修改章程使公司存续的。