公司股东变更债务应当由公司承担。公司股东变动的，原股东应将公司的真实状况告知新股东，并经双方确认后签订股权转让协议。变更后债权债务即由新股东在其出资范围内承担。公司是企业法人，有独立的法人财产，享有法人财产权。公司以其全部财产对公司的债务承担责任。

有限责任公司股东变更的流程

有限责任公司股东变更的流程：1、法定代表人签署的《公司变更登记申请书》（领取，公司加盖公章）；2、《企业（公司）申请登记委托书》（领取，公司加盖公章），应标明具体委托事项和被委托人的权限；3、有限责任公司变更股东提交原股东会决议（内容包括：转让双方当事人、转让标的、数额，其他股东优先受让权力的行使情况等，由股东盖章或签字（自然人股东）；国有独资公司有限责任公司变更出资人提交国务院或者国务院授权的机构、部门转让出资的文件。4、转让双方签署的股权转让协议；5、有限责任公司变更股东提交新股东会决议（内容包括：新的股东会成立，修改公司章程，决定是否调整经营管理机构由股东盖章或签字（自然人股东）；股份有限公司变更股东提交新股东会决议（内容包括：新的股东会成立，修改公司章程，决定是否调整经营管理机构，由发起人盖章或者出席会议的董事签字）。6、章程修正案：有限责任公司由股东盖章或签字（自然人股东）；股份有限公司由发起人盖章或出席会议的董事签字；国有独资有限责任公司由投资人盖章。7、新股东或发起人股受让人或者国有独资有限责任公司出资人的法人资格证明或自然人身份证明；8、法律、行政法规规定公司变更股东或发起人应报经审批的，提交有关部门的批准文件；9、公司营业执照正副本。注：依照公司登记管理条例设立的公司申请股东、发起人变更或者股份转让的变更登记适用本规范。由于股东或发起人的变更而使公司登记事项、备案事项发生变更的，应按有关变更登记的规定提交相应的文件。

《中华人民共和国公司法》第三条

公司是企业法人，有独立的法人财产，享有法人财产权。公司以其全部财产对公司的债务承担责任。有限责任公司的股东以其认缴的出资额为限对公司承担责任；股份有限公司的股东以其认购的股份为限对公司承担责任。