保税货物跨关区深加工结转是指加工贸易（来料加工、进料加工）企业将保税料件加工的产品结转至另一直属海关关区内的加工贸易企业深加工后复出口的经营活动。未经加工的保税进口料件不得结转。

海关对保税货物深加工结转采用计划审批制度，转出企业在申领《加工贸易登记手册》（以下简称《登记手册》）后，即可凭《中华人民共和国海关加工贸易保税货物结转深加工申请表》（以下简称《申请表》）向海关预申报结转计划。经转入地海关同意后，可分批办理结转送货手续。

海关对深加工结转的保税货物采用转关运输和不按转关运输两种方式进行监管。不按转关运输办理结转的，企业按《申请表》内容进行实际送货后统一在调入地海关办理结转报关手续；按转关运输办理结转的，在每一次交货前必须分别在转出、转入地海关办理结转报关手续。