政府可以限期拆除。如拒不自行拆除，县级政府俯依法强制拆除或者申请法院强制拆除。

《城乡规划法》第六十八条

城乡规划主管部门作出责令停止建设或者限期拆除的决定后，当事人不停止建设或者逾期不拆除的，建设工程所在地县级以上地方人民政府可以责成有关部门采取查封施工现场、强制拆除等措施。

《土地管理法》第八十三条

依照本法规定，责令限期拆除在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施的，建设单位或者个人必须立即停止施工，自行拆除；对继续施工的，作出处罚决定的机关有权制止。建设单位或者个人对责令限期拆除的行政处罚决定不服的，可以在接到责令限期拆除决定之日起十五日内，向人民法院起诉；期满不起诉又不自行拆除的，由作出处罚决定的机关依法申请人民法院强制执行，费用由违法者承担。

一、违建房屋多年是否有时效限制

对违章建筑行政处罚不受时效限制。

1.《行政处罚法》第29条规定了行政处罚的时效限制，“违法行为在二年内未被发现的，不再给予行政处罚。法律另有规定的除外。前款规定的期限，从违法行为发生之日起计算；违法行为有连续或者继续状态的，从行为终了之日起计算。”这条规定的立法原意是美好的，它一方面规定了行政机关必须提高行政处罚的效率，另一方面保护了当事人的合法权益，限制其处罚权的滥用。但是这条规定在立法表述和实际运用中存在着很多问题。一是“发现”一词使得行政机关在行使处罚权时由被动变主动，只要违法行为在两年内被发现，什么时候处罚行政机关说了算。二是起算点的问题，这也是我不太明白的地方。比如，一个人违章建筑，未办理任何施工等许可证明，等到过了两年期限后，被行政机关发现，拟作出处罚。

2.《行政处罚法》第二十九条规定，起算点是违法行为终了之日起计算，因为经过两年，显然已过了处罚的时效。而是应该处罚，因为违章建筑一直存在，所以就被视为违法行为没有终了，除非违法人哪一天偷偷拆除。但是也有人提出反对意见，认为此处把违法行为和违法结果混为一谈，如果说违章建筑是一种违法行为继续状态存在的形式的话，那么《行政处罚法》的追溯期的起止时间就没有止境了，这不符合法，也偏离了法律正义的客观需求，这种行政处罚的严厉程度已经和对社会最具破坏力的犯罪行为的惩罚限度相等同，这是不可思议的。所以，违章建筑只是一个物化了的违法行为的结果，而不是违法行为本身，违章建筑的存在并不是违法行为的继续或连续状态，除非该违章建筑在不停地改建或扩建当中。实际操作中，行政部门往往是这么认定的：违章建筑存在的属性，即当其对规划产生影响时，就存在了这一属性。

3.《城市规划法》的规定，对违章建筑的处理要考虑到两个因素，一是建设行为，二是建设结果对规划的影响。

4.最高法院行政庭在《关于对〈中华人民共和国城市规划法〉第40条如何适用的答复》((1995)法行字第15号)中明确回答：“违反城市规划的行为人其违法行为是否属于‘严重影响城市规划’，应从其违法行为的性质和后果来确认。”所以，行政部门认为，若当事人所建设的建筑物不符合规划，违章建筑对规划的影响就始终存在，则应视为持继状态。这一点在涉及数个违法行为所建造的违章建筑中尤为明显。如在公路红线控制区内的违章建筑，水利工程中管理范围内的违章建筑，其存在就是对道路的交通安全、水利安全的影响，这显然也是一种持续的状态。”