被检察院决定不起诉决定的当事人是否会有案底要视具体情况而定：

1、如果犯罪嫌疑人是因没有违法犯罪事实而被决定不起诉的，则不会有案底。

2、如果犯罪嫌疑人不是因没有违法犯罪事实而被决定不起诉，而且因犯罪情节轻微或具有《刑事诉讼法》第十五条规定的情形之一而被不起诉的，仍会有本应的案底记载。

一、不起诉的案件会有案底吗

有案底。公诉机关对其作出的不起诉决定不代表其所涉犯罪事实被抹除、其所涉刑事犯罪罪名被削除、相应刑事责任被免除。故而通俗的讲，本案在侦查、公诉机关是有“案底”的。因为这个不起诉决定不代表给其销案销罪销责，所涉罪案依法结案后，案卷依法归档留存。本人有这个罪案记录在，无犯罪证明无从谈起。

二、存疑不起诉的有案底吗

存疑不起诉没有案底。存疑不起诉是检察机关对于经过补充侦查的案件，仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，作出的不起诉决定；如果犯罪嫌疑人是因证据不足以证明其存在违法犯罪事实而被决定不起诉的，则不会有案底。

三、不起诉不受理检察院有案底吗

检察院不起诉的是不会有案底的。案底是犯罪记录，如果人民法院依法审判，判处有罪的，才会有案底，检察院不起诉是不会有案底的。如果当事人有犯罪行为，但是由于法定的情形，不需要追究其刑事责任的，检察院可以作出不予起诉的决定。