建设工程合同纠纷案件的证据有：建筑公司工商登记资料；招标文件、中标通知书；建设工程施工合同、施工过程中增减工程量的补充合同；工程预、决算报告、支付工程款的付收款凭证；工程验收、结算凭证、质检报告等。

一、工程司法鉴定需要准备哪些材料

工程造价鉴定中鉴定机构可能需要的资料一般包括：（1）诉讼案件当事人的起诉状、答辩状、庭审笔录或仲裁案件申请人、被申请人的申请书、答辩状；（2）当事人共同认定的相关专业工程设计图纸、设修改、变更通知单、现场签证单、技术核定单、图纸会审记录；（3）当事人签订的施工合同、协议、补充协议；

（4）开工报告、竣工工程验收证明或其它能够证明实际开工、竣工时间的资料；（5）当事人共同认定的主要材料、设备采购发票、加工订货合同以及建设单位供应的建筑材料、设备清单；（6）工程预算书、工程结算书、财务资料；（7）招投项目中的招投标文件、中标通知书；（8）调查询问笔录、现场勘察记录；（9）经建设单位批准的施工组织设计、年度形象进度记录；（10）当事人共同认定的其它涉及该工程造价鉴定的照片、录音、录像等相关证据材料。

二、拖欠工程款的诉讼要准备什么材料

1、当事人诉讼主体资格的证据，本类证据大致是双方的工商登记资料，如营业执照或工商查询资料，若涉及起诉时双方企业名称与原签订合同时不一致的，还应提交证明双方名称变更的证据。

2、证明建设工程合同关系成立的证据，本类证据主要是建设工程施工合同、施工过程中增减工程量的补充合同（或协议、备忘录、现场工程签证单等）。

3、证明建设工程合同履行情况的证据：

（1）工程预、决算报告；

（2）支付工程款的付（收）款凭证；

（3）当事人对工程量、工程质量共同确认的证据，如工程验收、结算凭证，质检报告等。

4、提交诉讼请求的计算依据，因建设单位拖欠工程款，施工单位在起诉时可依据《建设工程施工合同》的约定要求对方承担违约金；

若合同没有违约金条款，可要求对方支付一定金额的逾期付款利息。

三、工程承包合同有哪几种形式

工程承包合同有以下几种形式：

1、总价合同，以固定总价签订的合同称为总价合同，可分为固定总价合同、调价合同和固定工程量总价合同；

2、固定单价合同，又称工程量清单合同；

3、成本加薪合同；

4、分包合同。

建设工程合同是承包人进行工程建设，发包人支付价款的合同。建设工程合同包括工程勘察、设计、施工合同。