双方签字的借款协议是否有效要看协议是否符合合同生效实质要件，如果符合的则借款协议有效；反之借款协议则无效。合同生效的要件如下：1.当事人具有相应的订立合同的能力。2.合同意思表示真实。3.合同不违反法律和社会公共利益。

一、合同成立和生效的要件

1.当事人在订立合同时必须具有相应的订立合同的行为能力。这实质上是法律对合同主体资格作出的一种规定。主体不合格，所订立的合同不能发生法律效力。

2.合同当事人的意思表示真实。这是合同有效的另一个要件。所谓意思表示真实，是指当事人在缔约过程所作的要约和承诺都是自己独立且真实意志的表现。

3.合同不违反法律，符合社会公共利益。这是合同生产要件中最为重要的一个。合同欠缺合法性，没有补救的余地，只能归于完全无效。合同违反法律和社会公共利益，其所指包括合同的目的和内容两个方面，即合同的目的和内容都不得违反法律或社会公共利益。这里所说的法律，既包括现行法律、法规和行政规章中的强制性也包括国家政策的禁止性规定和命令性规定。