对于婚姻存续期间购置的小产权房屋，法院会根据该小产权房的具体情况以不同的方式处理：

1、对于已被有权机关认定为违法建筑的，不予处理；但违法建筑已经行政程序合法化的，可以对其所有权归属做出处理。

2、对于虽未经行政准建，但长期存在且未受到行政处罚的房屋，可以对其使用权归属做出处理。

3、在仅能处理使用权时，法院会向当事人释明并允许当事人变更相关诉讼请求。在处理相关房屋的使用权时，能分割的进行分割，不能分割的进行折价补偿，房屋折价时可采用竞价方式确定价格。

一、如何进行小产权房交易

1、看房：买卖双方相约实地考察房屋，并且初步洽谈价格、付款方式、交房日期等事项

2、查档：买卖双方拿着房产证原件或按揭合同原价前往档案大厦国土部门查房档案。

3、签合同：交易双方可以就房屋价格、定金、首期款等内容进行进一步协商，确认无误后，买卖双方签订合同。

4、公证卖方同担保公司一起到公证处进行公证，并委托担保公司办理相关事务。

5、资金监管及贷款申请：买方支付首期款到银行资金监管账号，然后跟担保公司一起和银行签订资金监管协议及相关文件，并向银行提出贷款申请，银行同意贷款后出具贷款承诺书给买方，或者直接通知担保公司，时间大概在约7到8个工作日左右。

6、赎楼：买方支付担保费用后，担保公司会向原贷款银行申请赎楼，然后出具赎楼担保，并进行赎楼以及注销抵押登记手续。

7、过户：买方同担保公司去房地产产权登记中心办理过户手续，在递交房产过户申请后，担保公司领取回执。

8、缴费：买方同担保公司到相关部门缴费并领取新的房产证后，担保公司会带着房产证同银行在产权登记中心作抵押登记，银行把首期款给卖方。新房产证抵押登记后，银行把扣除赎楼贷款后的贷款给卖方，时间大约在10个工作日左右。

9、交房：买卖双方办理房屋交接，以及水、电等费用的过户，买方领取钥匙。

二、小产权房有哪些产生原因

1、城市房价过高：中国许多大中城市的高房价是催生小产权房的重要原因之一。由于中国经济社会发展不平衡，若干大城市的房价长期快速上涨，远远超出了当时当地一般就业人员的收入水平。与此同时，政府经济适用房、廉租房的建设无法满足这些住房需求。小产权房存在着大量现实的购买群。

2、擦边球的空间：根据法律规定，在农村集体所有的宅基地和集体建设用地上，农民可以自行经营，而且农民自建的住房也是可以进行交易的。正是因为政策法律规定中存在很多模糊不清的地方，才导致了各地小产权房建设的泛滥，在合法与非法之间给小产权房留下了一个擦边球的空间。

3、农地制度不合理：小产权房是农民集体自发在其集体所有的集体建设用地和宅基地上建设的房产，不需要缴纳类似开发商为获取土地交给政府的土地使用权出让金（其中包括由政府出面征收农民集体土地支付的征地费用）；由村集体牵头开发，省去了基础设施配套费等市政建设费用及成本费。在这一开发过程中，农民集体通过出售小产权房获得的收益高于政府征收土地的补偿金额。