依据法律规定，公司以其资产承担债务，如果资产不足以清偿债务的，剩下的债务公司不需要承担，但有特殊情况的除外，需要承担责任的情形：1．股东瑕疵出资：在司法实践中股东瑕疵出资主要是指股东出资不实，如注册资金不到位、虚假出资、虚报注册资本等情况。该种情形，即使公司注销，也将对公司债务承担连带清偿责任。2．资本抽逃或转移：如果股东出资后又抽逃、转移部分或全部资金，导致公司不具备履约能力的，股东应在抽逃原公司资产的范围内对原公司债务承担连带清偿责任。3．清算程序不合法：公司法要求注销公司应当经过合法的清算程序，包括告知债权人主张债权等，否则即便已经注销也可以要求股东承担赔偿责任。

公司注销股东的投资款如何处理

公司清算时，股东投资款是公司资产，用于清算公司债务，清算结束后，有剩余的，按股东出资比例分配给股东。处理完资产后，才注销公司。《中华人民共和国公司法》第一百八十六条【清算程序】清算组在清理公司财产、编制资产负债表和财产清单后，应当制定清算方案，并报股东会、股东大会或者人民法院确认。公司财产在分别支付清算费用、职工的工资、社会保险费用和法定补偿金，缴纳所欠税款，清偿公司债务后的剩余财产，有限责任公司按照股东的出资比例分配，股份有限公司按照股东持有的股份比例分配。清算期间，公司存续，但不得开展与清算无关的经营活动。公司财产在未依照前款规定清偿前，不得分配给股东。第一百八十八条【公司注销】公司清算结束后，清算组应当制作清算报告，报股东会、股东大会或者人民法院确认，并报送公司登记机关，申请注销公司登记，公告公司终止。

《最高人民法院关于适用若干问题的规定（二）》第二十二条，公司财产不足以清偿债务时，债权人主张未缴出资股东，以及公司设立时的其他股东或者发起人在未缴出资范围内对公司债务承担连带清偿责任的，人民法院应依法予以支持。