依据我国刑法的规定，职务侵占罪的违法所得会被追缴，如果确定是被害人的会进行退赔，没有被害人的会被上缴到国库。相关法律规定《中华人民共和国刑法》第六十四条【犯罪物品的处理】犯罪分子违法所得的一切财物，应当予以追缴或者责令退赔；对被害人的合法财产，应当及时返还；违禁品和供犯罪所用的本人财物，应当予以没收。没收的财物和罚金，一律上缴国库，不得挪用和自行处理。第二百七十一条【职务侵占罪】公司、企业或者其他单位的人员，利用职务上的便利，将本单位财物非法占为己有，数额较大的，处五年以下有期徒刑或者拘役；数额巨大的，处五年以上有期徒刑，可以并处没收财产。国有公司、企业或者其他国有单位中从事公务的人员和国有公司、企业或者其他国有单位委派到非国有公司、企业以及其他单位从事公务的人员有前款行为的，依照本法第三百八十二条、第三百八十三条的规定定罪处罚。职务侵占立案后的程序是怎样的首先公安机关需要对相关的立案文件，就包括公民的报案、个人或单位的控告、举报和自首材料文件进行整理，侦查结束之后，就需要一并移交到当地相关的人民检察院进行审查，相关的部门对立案文件进行整理和分类等。其次，相关部门必须要公正客观并且认真的对相关的立案材料进行审查，并对相关的立案材料进行核对调查，检查相关立案材料是否齐全、相关的证据材料的真实性以及相关证据材料的时效性等。最后，相关部门在进行审查通过后开始对立案材料进行评估，根据立案材料针对不同的情况决定立案是否通过，如果立案通过，人民法院将会对公安机关、人民检察院提供的材料内容根据相关法律进行评估，对职务侵占的当事人进行审判量刑。依据我国刑法的规定，职务侵占罪的违法所得会被追缴，如果确定是被害人的会进行退赔，没有被害人的会被上缴到国库。