果树征收补偿一般按照政府文件以及当年的果树市场进行估价，当年的按照苗木价，多年的则按照直径、高度、宽度进行估价。但是各地区的青苗补偿标准都不一样，每亩多于规定棵数的按标准计补，少于规定棵数的则按每棵树对应的单价和实际清点棵数计补。

1、可以采用果树主干的横断面面积来计算果树产量，再根据果品的单价来计算年产值。年产值的3倍即为果树的价值，如果全园树体大小不一，则随机采样（20株以上）来计算横截面积。用皮尺测量出树干（距离地面20厘米左右）的周长，然后根据周长计算出横截面积（用平方厘米表示）。在果树价值评估时经常采用此方法。

2、另一种方法是按照幼苗期、初结果期、盛果期等果树生长周期，每株按照一定价格大体赔偿的（具体赔偿标准根据树种和省份而定）。不论采用何种方法赔偿，都要经过当地果树主管部门的评估或鉴定，一般由法院或征地部门委托鉴定才会生效。