有时间限制。新型农村合作医疗制度一般采取以县（市）为单位进行统筹。新型农村合作医疗报销的期限一般是就诊后在该年度申请，隔年一般是不能够申请的，所以一般要在次年1月底之前全部结清。如果是年底就诊需跨年度报销的也不能超过2个月。我国相关政策规定，农村合作医疗保障期限为一年。

农村合作医疗住院报销多少

农村合作医疗住院报销如下：

1．门诊补偿：村卫生室及村中心卫生室就诊每次处方药费限额10元，卫生院医生临时补液处方药费限额50元。镇卫生院就诊每次各项检查费及手术费限额50元，处方药费限额100元。二级医院就诊每次各项检查费及手术费限额50元，处方药费限额200元。三级医院就诊每次各项检查费及手术费限额50元，处方药费限额200元。中药发票附上处方每贴限额1元。镇级合作医疗门诊补偿年限额5000元。

2．住院补偿：药费：辅助检查：心脑电图、X光透视、拍片、化验、理疗、针灸、CT、核磁共振等各项检查费限额200元；手术费（参照国家标准，超过1000元的按1000元报销）。

《关于建立新型农村合作医疗制度的意见》二、组织管理（一）新型农村合作医疗制度一般采取以县（市）为单位进行统筹。条件不具备的地方，在起步阶段也可采取以乡（镇）为单位进行统筹，逐步向县（市）统筹过渡。