保险公司在合同生效两年后自杀拒绝赔偿是不合理的。根据法律规定，被保险人自合同成立或者恢复合同效力之日起两年内自杀的，保险人不承担给付保险金的责任，保险人也不承担给付保险金的责任。根据《中华人民共和国保险法》第四十四条的规定，被保险人自合同成立或者恢复合同效力之日起两年内自杀的，保险人不承担给付保险金的责任，但被保险人是无国籍人的除外自杀时的民事行为能力。保险人依照前款规定不承担给付保险金责任的，应当按照合同约定返还保险单的现金价值。