存疑不起诉是可以申请国家赔偿的。如果出现存疑不起诉的情况，说明相关部门对案件的证据不足，且不符合起诉条件，因此此案件被羁押的人员是无罪的。国家的赔偿一般以支付赔偿金为主，并且需要返还其财产以及恢复原状。因此国家在行使公权的行为时，对其造成的损害后果，需要承担赔偿责任。

存疑不起诉再起诉概率大吗

1、存疑不起诉再起诉概率可能大，也可能小。存疑不起诉后需要重新起诉的必须要确定掌握了他人犯罪的证据。作为公安、检察机关也不应忽视客观存在的社会对存疑不起诉人的消极评价，为保障其权利，应加大对存疑不起诉案件的补查力度，尽量缩短查清案件的时间，早日给存疑不起诉人一个有罪无罪的明确结论。

2、法律依据：

《人民检察院刑事诉讼规则》

第三百六十九条人民检察院根据《刑事诉讼法》第一百七十五条第四款规定决定不起诉的，在发现新的证据，符合起诉条件时，可以提起公诉。

《刑事诉讼法》

第一百七十五条第四款对于二次补充侦查的案件，人民检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，应当作出不起诉的决定。

《中华人民共和国国家赔偿法》第十五条

行使侦查、检察、审判、监狱管理职权的机关及其工作人员在行使职权时有下列侵犯人身权情形之一的，受害人有取得赔偿的权利：

（一）对没有犯罪事实或者没有事实证明有犯罪重大嫌疑的人错误拘留的；

（二）对没有犯罪事实的人错误逮捕的；

（三）依照审判监督程序再审改判无罪，原判刑罚已经执行的；

（四）刑讯逼供或者以殴打等暴力行为或者唆使他人以殴打等暴力行为造成公民身体伤害或者死亡的；

（五）违法使用武器、警械造成公民身体伤害或者死亡的。