根据国家税务总局文件的规定，以无形资产或不动产投资入股，参与接受投资的利润分配、共同承担投资风险的行为，不征收营业税。但转让该项股权，应按“转让无形资产”或“销售不动产”税目缴纳营业税。

按照以上文件的规定，你们单位转让股权所取得的收入应该按照“转让无形资产”税目缴纳营业税。但对于你们公司用厂房、设备、商标、商誉作为投资入股的行为不需缴纳营业税。