如果当事人的护照被派出所扣留，可以去派出所询问一下扣证的原因。一般扣押期限届满就会退回；或者经查验无违法犯罪行为的，就会提前退回。公安机关负责护照管理，公安机关认为在有需要的特殊情况下，可以暂停护照使用。护照被派出所扣留的法律依据

《中华人民共和国护照法》第四条

普通护照由公安部出入境管理机构或者公安部委托的县级以上地方人民政府公安机关出入境管理机构以及中华人民共和国驻外使馆、领馆和外交部委托的其他驻外机构签发。

《中华人民共和国居民身份证法》第十五条

人民警察依法执行职务，遇有下列情形之一的，经出示执法证件，可以查验居民身份证：

（一）对有违法犯罪嫌疑的人员，需要查明身份的；

（二）依法实施现场管制时，需要查明有关人员身份的；

（三）发生严重危害社会治安突发事件时，需要查明现场有关人员身份的。

《中华人民共和国居民身份证法》（2011修正）：第三章　使用和查验　　第十五条　人民警察依法执行职务，遇有下列情形之一的，经出示执法证件，可以查验居民身份证：\n（一）对有违法犯罪嫌疑的人员，需要查明身份的；\n（二）依法实施现场管制时，需要查明有关人员身份的；\n（三）发生严重危害社会治安突发事件时，需要查明现场有关人员身份的；\n　　（四）在火车站、长途汽车站、港口、码头、机场或者在重大活动期间设区的市级人民政府规定的场所，需要查明有关人员身份的；\n（五）法律规定需要查明身份的其他情形。\n有前款所列情形之一，拒绝人民警察查验居民身份证的，依照有关法律规定，分别不同情形，采取措施予以处理。\n任何组织或者个人不得扣押居民身份证。但是，公安机关依照《中华人民共和国刑事诉讼法》执行监视居住强制措施的情形除外。