对于交通肇事逃逸的行为，保险公司只赔付交强险，商业险不进行赔偿。

第一，对于交强险部分，相关法律并未将肇事逃逸归入保险公司的免责事由之内，且《民法典》明确规定，机动车驾驶人发生交通事故后逃逸；

该机动车参加强制保险的，由保险公司在机动车强制保险责任限额范围内予以赔偿。

第二，在商业第三者责任保险中，交通肇事逃逸的影响只及于事故发生之后，投保人只应对逃逸行为扩大损害的部分负责。

保险人以肇事逃逸由为免除自己的全部赔偿责任，违反公平原则、诚实信用原则和保险法的规定，属于无效条款。

一、三者险肇事逃逸能赔偿吗

事故逃逸车辆的交强险必须对第三者损失作出赔偿，而商业三者险要依照合同条款约定决定是否赔偿。根据《机动车交通事故责任强制保险条例》第二十二条，有下列情形之一的，保险公司在机动车交通事故责任强制保险责任限额范围内垫付抢救费用，并有权向致害人追偿：(一)驾驶人未取得驾驶资格或者醉酒的;(二)被保险机动车被盗抢期间肇事的;(三)被保险人故意制造道路交通事故的。有上述所列情形之一，发生道路交通事故的，造成受害人的财产损失，保险公司不承担赔偿责任。因此机动车交通事故责任强制保险没有把逃逸作为免赔条款，但一般商业险中的机动车第三者责任险都会把逃逸作为免赔条款。故而事故逃逸车辆的交强险必须对第三者损失作出赔偿，而商业三者险要依照合同条款约定决定是否赔偿。

二、发生交通事故后逃逸的要承担全责保险公司赔偿么

对于交通肇事逃逸的行为，保险公司只赔付交强险，商业险不进行赔偿。

对于交强险部分，相关法律并未将肇事逃逸归入保险公司的免责事由之内，机动车驾驶人发生交通事故后逃逸，该机动车参加强制保险的，由保险公司在机动车强制保险责任限额范围内予以赔偿。