工程纠纷可以找的部门：工程纠纷应该找劳动或者司法部门，比如公安局，人民法院。在项目法人出资人出资到位的情况下，施工企业只应以项目法人为被告。根据法律规定，受害人可以根据《民事诉讼法》的规定向法院提起民事诉讼。

工程纠纷终审申诉流程

1、递交申诉状，应当载明当事人的基本情况、申诉的请求、申诉事实与理由。

2、申诉人对已生效的刑事判决、裁定提出申诉，应向作出生效裁判的人民法院提出。

3、申诉人向人民法院提出申诉，人民法院对符合申诉条件的刑式案件进行申诉立案．申诉立案的刑事案件只有经审查后，申诉符合《中华人民共和国刑事诉讼法》第二百零四条规定的再审条件之一的，案件才能进入再审程序，予以再审立案。

经人民法院审查，认为原刑事判决、裁定正确的申诉案件，人民法院应当说服申诉人服判息诉。如坚持无理申诉的，可采取书面或口头形式予以驳回。

《民事诉讼法》第一百一十九条

起诉必须符合下列条件：

（一）原告是与本案有直接利害关系的公民、法人和其他组织；

（二）有明确的被告；

（三）有具体的诉讼请求和事实、理由；

（四）属于人民法院受理民事诉讼的范围和受诉人民法院管辖。