甲乙双方工程结算异议可以通过以下方式解决：

1、是通过双方协商解决，若是协商达不成一致，可请第三方调解；

2、若调解不成，可提请仲裁或起诉至人民法院，请求法院判决执行。

起诉至人民法院，甲乙双方要投入大量时间、财力和精力，还将影响双方信誉，故能协商解决的不请第三方调解，能调解解决的不请求仲裁或起诉至人民法院。

工程结算编制依据

1、国家有关法律、法规、规章制度和相关的司法解释；

2、国务院建设行政主管部门以及各省、自治区、直辖市和有关部门发布的工程造价计价标准、计价办法、有关规定及相关解释；

3、施工方承包合同、专业分包合同及补充合同，有关材料、设备采购合同；

4、招投标文件，包括招标答疑文件、投标承诺、中标报价书及其组成内容；

5、工程竣工图或施工图、施工图会审记录，经批准的施工组织设计，以及设计变更、工程洽商和相关会议纪要；

6、经批准的开、竣工报告或停、复工报告；

7、建设工程工程量清单计价规范或工程预算定额、费用定额及价格信息、调价规定等；

8、工程预算书；

9、影响工程造价的相关资料；

10、安装工程定额基价；

11、结算编制委托合同。

《建设工程价款结算暂行办法》第二十条当事人对工程造价发生合同纠纷时，可通过下列办法解决：

（一）双方协商确定；

（二）按合同条款约定的办法提请调解；

（三）向有关仲裁机构申请仲裁或向人民法院起诉。