对于乘客与司机殴打发生交通事故其处罚也是具体情况而定的：

1.公交车司机在车辆行驶中擅离职守足以危及公共安全的行为应按以危险方法危害公共安全罪定罪处罚；

2.乘客殴打正在驾驶车辆的司机从而引发交通事故的，大致有两种情形：

（1）是殴打行为足以致驾驶人员失去对车辆的有效控制，从而直接引发交通事故的；

这种情形，车辆失去控制造成交通事故是由乘客殴打行为直接所致，因果关系明显。对此，行为人的行为如符合故意伤害罪、以危险方法危害公共安全罪的构成的，应当以此定罪量刑。

（2）是殴打行为不足以致驾驶人员失去对车辆的有效控制，但引发驾驶人员擅离驾驶岗位进行互殴，导致车辆失去控制，进而间接引发交通事故的。

这种情形，车辆失去控制造成交通事故虽是由驾驶人员擅离职守直接所致，但乘客的殴打行为又是引发驾驶人员擅离职守与其对殴的惟一原因。对此，行为人的行为构成过失以危险方法危害公共安全罪。