医疗机构不配合医疗事故鉴定的情况，卫生部特意做出说明，对于那些不配合的医疗单位，需要其承担医疗事故责任，同时如果医疗机构对鉴定不服还不能申请重新鉴定。卫生部强调，医疗机构违反《医疗事故处理条例》的有关规定，不如实提供相关材料或不配合相关调查，导致医疗事故技术鉴定不能进行的，应当承担医疗事故责任。患者向卫生行政部门提出判定医疗事故等级及责任程度请求的，卫生行政部门可以委托医学会按照《医疗事故分级标准(试行)》，对患者人身损害的后果进行等级判定，若二级、三级医疗事故无法判定等级的，按同级甲等定。责任程度按照完全责任判定。

一、当事人能否申请医疗事故鉴定

当事人能申请医疗事故鉴定。受理条件：对不符合受理条件的，医学会不予受理。不予受理的，医学会应说明理由。有下列情形之一的，医学会不予受理医疗事故技术鉴定：(一)当事人一方直接向医学会提出鉴定申请的；(二)医疗事故争议涉及多个医疗机构，其中一所医疗机构所在地的医学会已经受理的；(三)医疗事故争议已经人民法院调解达成协议或判决的；(四)当事人已向人民法院提起民事诉讼的(司法机关委托的除外)；(五)非法行医造成患者身体健康损害的；(六)卫生部规定的其他情形。

二、医疗事故鉴定怎么做？

根据我国法律的规定，医疗事故鉴定的流程如下：

1、提出医疗事故争议；

2、申请医疗事故技术鉴定；

3、接到医疗事故鉴定书后，根据鉴定结果，双方可以可自行协商赔偿，也可以申请卫生局调解、或者申请由法院判赔；

4、任何纠纷解决后，各医疗单位必须在7日内将处理结果以书面形式上报市卫生局。

根据《医疗事故处理条例》第二十条的规定，卫生行政部门接到医疗机构关于重大医疗过失行为的报告或者医疗事故争议当事人要求处理医疗事故争议的申请后，对需要进行医疗事故技术鉴定的，应当交由负责医疗事故技术鉴定工作的医学会组织鉴定；医患双方协商解决医疗事故争议，需要进行医疗事故技术鉴定的，由双方当事人共同委托负责医疗事故技术鉴定工作的医学会组织鉴定。以上是对这个问题的解答。