网上发票认证的操作方法：

1、企业必须已完成网上报税的申请，携带有关材料到税务机关拷贝网上认证密钥文件；

2、登录企业电子报税管理系统，在公司资料设置中导入网上认证密钥文件；

3、在系统配置界面，将“本企业采用的认证方式”更改为“录入发票认证文件到税局认证”；

4、在进项发票管理下，新增防伪税控进项专用发票，将当月需要认证的发票逐项录入；

5、在进项发票管理下，点击待认证进项专用发票导出，选择录入日期，核对发票清单无误后确认即可；

6、登录税务局网站，打开网上办税，发票认证，将前一步生成的待认证文件上传；

7、网上办税-发票认证选项卡里选择认证结果下载，下载成功后，再将该结果上传到企业电子报税管理系统里即可。