一、刑事案件两次退侦后检察院怎么办理

在刑事案件中，若检察院两次退回公安机关补充侦查后，检察院应如何处理呢？

1．依据我国刑事诉讼法的相关规定，检察院在审查起诉过程中，若认为案件证据不足，可以退回公安机关补充侦查，且补充侦查以二次为限。

2．若经过两次补充侦查后，检察院仍认为证据不足，不符合起诉条件的，应当作出不起诉决定。

这意味着，对于经过两次退侦的案件，检察院将不再提起公诉，案件将终止于审查起诉阶段，犯罪嫌疑人将不会被起诉处理。

二、补充侦查期限的规定

补充侦查的期限规定主要分为两个阶段：

1．审查起诉阶段的补充侦查：

（1）人民检察院在审查案件时，如需补充侦查，可以退回公安机关补充侦查，也可以自行侦查。

（2）补充侦查应当在一个月内完成，且补充侦查以二次为限。

（3）补充侦查完毕后，案件将重新移送人民检察院，人民检察院将重新计算审查起诉期限。

2．法庭审理阶段的补充侦查：

（1）在法庭审理过程中，如检察人员发现案件需要补充侦查，并提出补充侦查建议的，人民法院可以延期审理。此时，补充侦查也应在一个月内完成。

（2）如合议庭在审理过程中发现被告人可能有自首、立功等法定量刑情节，而起诉和移送的证据材料中缺乏相关证据材料的，可以建议人民检察院补充侦查。

三、公安机关退侦撤案处理

对于公安机关在退侦撤案过程中的处理，主要有以下几个方面：

1．对于证据不足的案件：

（1）公安机关应在补充证据后，制作补充侦查报告书，移送检察院审查起诉。若无法补充相关证据，公安机关应对此作出说明。

（2）即使在补充侦查后证据依然不充分，公安机关也不能自行处理，必须移送检察院审查决定起诉或不起诉。

2．在补充侦查过程中：

（1）如公安机关发现新的同案犯或新的罪行，需要追究刑事责任的，应重新制作起诉意见书，移送检察院审查。

（2）此时，侦查羁押期限和审查起诉期限需要重新计算，但公安机关不能撤销原案件。

3．如发现原认定的犯罪事实有重大变化，不应再追究刑事责任的，犯罪嫌疑人没有犯罪事实等法定情形，公安机关应重新提出处理意见，并将处理结果通知退查的检察院。