软件著作权分开申请，依据具体情况进行。软件著作权属于一种民事权利，具备民事权利的共同特征。软件经过登记后，软件著作权人享有发表权、开发者身份权、使用权、使用许可权和获得报酬权。

一、软件著作权要怎么申请

软件著作权可以按照以下流程申请：

1、到版权保护中心申请软件著作权登记；

2、提交申请书等需要的材料；

3、符合条件的，会作出受理决定并发放受理通知书；

4、审核通过后予以登记，发给登记证书，并公告。

根据《计算机软件保护条例》第六条的规定，本条例对软件著作权的保护不延及开发软件所用的思想、处理过程、操作方法或者数学概念等。

第七条第一款规定，软件著作权人可以向国务院著作权行政管理部门认定的软件登记机构办理登记。软件登记机构发放的登记证明文件是登记事项的初步证明。

二、软件著作权对软件的著作权有哪些限制?

时间限制:软件开发者的开发者身份权保护期不受限制。软件著作权的其他权利保护期为25年，截止于软件首次发表后第25年的12月31日，保护期满前，软件著作权人可以向软件登记机关申请续展25年，但保护期最长不超过50年。

2、在保护期内，因课堂教学、科学研究、国家机关执行公务等非商业性目的的需要对软件进行少量复制，可以不经软件著作权人同意，不向其支付报酬。

3、软件著作权人不得损害公众利益，违反其他法律。

4、软件复制品合法持有人，在不经该软件著作权人同意的情况下，可以根据使用的需要把该软件装入计算机内，制作备份复制品，进行必要的修改等。

三、软件著作权有没有年限

软件著作权有年限，五十年。软件著作权自软件开发完成之日起产生，自然人的软件著作权，保护期为自然人终生及其死亡后50年，截止于自然人死亡后第50年的12月31日；软件是合作开发的，截止于最后死亡的自然人死亡后第50年的12月31日。但软件自开发完成之日起50年内未发表的，不再享有著作权的保护。