第一，房屋不会被强拆，如果说宅基地面积超标，一般都是属于历史遗留问题，对以前的老房子超标部分，只要不是违章建筑，是不会不强制拆除的。

第二，对于宅基地的确权不会有影响，大多数地方在进行宅基地确权的时候，会对宅基地的面积进行测量，若计算超标了国家有在这方面的相关规定。

一、在办理登记时对宅基地超占面积的是怎样处理的？

1、1982年《村镇建房用地管理条例》实施前，农村村民建房占用的宅基地，在《村镇建房用地管理条例》实施后至今未扩大用地面积的，可以按现有实际使用面积进行登记。

2、1982年《村镇建房用地管理条例》实施起至1987年《中华人民共和国土地管理法》实施时止，农村村民建房占用的宅基地，超过当地规定的面积标准的，超过部分按当时国家和地方有关规定处理后，可以按实际使用面积进行登记。

3、1987年《中华人民共和国土地管理法》实施后，农村村民建房占用的宅基地，超过当地规定的面积标准的，按照实际批准面积进行登记。其面积超过各地规定标准的，可在土地登记簿和土地权利证书记事栏内注明超过标准的面积，待以后分户建房或现有房屋拆迁、改建、翻建、政府依法实施规划重新建设时，按有关规定作出处理，并按照各地规定的面积标准重新进行登记。

在宅基地确权登记过程中，什么情形不予确权？

1、宅基地不符合《乡镇土地利用总体规划》；

2、除继承和分居立户外，农户一户超过一处以上的；

3、非本集体经济组织成员或城镇居民在农村购买和建造的住宅；

4、土地权属有争议尚未处理结束的；

5、农村村（居）民因新建住宅，应当拆除而未拆除的旧宅或旧宅纳入土地置换项目规划，未复垦的；

6、空闲或房屋坍塌、拆除两年以上未恢复使用的；

7、因拆迁或原住宅依法被征收，已依法进行统一安置或补偿的；

8、土地违法违规行为尚未处理或正在处理的；

9、经批准后连续两年未使用的；

10、集体供养的五保户腾出的住宅；

11、因依法查封地上建筑物和其他附着物等原因限制土地权利的；

12、法律法规、政策规定的其他不予确权的情形。

二、一处宅基地两处房子如何确权

一处宅基地两处房子无法确权。因为一处宅基地不能分为两户，如果村民拥有两处宅基地并且面积都达到标准的情况下，其中一处的宅基地有可能被村集体依法回收。农村村民建房占用的宅基地，超过规定面积标准的，按照实际批准面积进行确权登记，并在土地登记簿和土地权利证书记事栏内注明超过标准的面积，待以后分户建房或现有房屋搬迁、改建、翻建或政府依法实施规划重新建设时，按有关规定作出处理，并按照规定面积标准重新进行确权登记。

三、自建房罚款后算合法面积吗

自建房罚款后算合法面积需要根据实际情况判断。若建房已经办理了合法的审批手续，有相关的宅基地使用权证书、规划许可证，针对面积超标的情况主动向审批机关报告，补交一定费用，算合法面积。但是，如果隐瞒面积超标的情况，被有关部门查处到，就会被视为违章建筑，那么不仅需要进行罚款，还要被要求限期拆除。