女方提起起诉离婚的，两个孩子的分配由双方先协商确定，协议不成的由法院判决。一般两周岁以下的孩子，法院会判决由女方直接抚养，两周岁以上的会以更有利于孩子成长为原则进行判决。在有利于保护子女利益的前提下，人民法院支持父母双方协议轮流直接抚养子女。但是会对孩子造成不利影响的会不予支持。

民法典离婚两个孩子怎么分配

一般情况下，如果两个孩子都过了哺乳期，那么法院会判决一人抚养一个孩子，通过这种方法来分摊孩子成长所需要费用所带来的的压力。具体判决，通常还是要让人民法院按照孩子的权益、成长环境等双方的具体情况来决定。如果孩子还在哺乳期，俺么原则上会让母亲来抚养，另一方要给付抚养费。

《中华人民共和国民法典》第一千零八十四条父母与子女间的关系，不因父母离婚而消除。离婚后，子女无论由父或者母直接抚养，仍是父母双方的子女。

离婚后，父母对于子女仍有抚养、教育、保护的权利和义务。

离婚后，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。已满两周岁的子女，父母双方对抚养问题协议不成的，由人民法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决。子女已满八周岁的，应当尊重其真实意愿。