个人独资企业转让股份的方法是：个人独资企业可以向原登记机关提交转让协议书，然后申请变更登记。需要提提交投资人签署的变更登记申请书、国家工商行政管理总局规定提交的其他文件。

个人独资企业如何转让股份的法律依据

《个人独资企业登记管理办法》第十七条

个人独资企业因转让或者继承致使投资人变化的，个人独资企业可向原登记机关提交转让协议书或者法定继承文件，申请变更登记。个人独资企业改变出资方式致使个人财产与家庭共有财产变换的，个人独资企业可向原登记机关提交改变出资方式文件，申请变更登记。

第十四条

个人独资企业申请变更登记，应当向登记机关提交下列文件：

（一）投资人签署的变更登记申请书；

（二）国家工商行政管理总局规定提交的其他文件。

从事法律、行政法规规定须报经有关部门审批的业务的，应当提交有关部门的批准文件。委托代理人申请变更登记的，应当提交投资人的委托书和代理人的身份证明或者资格证明。