建设工程合同中常见的纠纷有：关于施工合同效力问题的纠纷；工程价款的纠纷；对于备案合同和“补充协议”结算时应采纳哪一份合同作为结算依据的纠纷；以及施工合同版本通用条款中涉及的发包方逾越不结算是否认可送审价的纠纷等等。

一、工程价款结算方式

工程价款的结算方式主要包括如下：1、实行分段结算。对于当年开工但当年不能竣工的项目，按照其工程形象进度划分不同阶段进行结算；2、竣工后一次结算。规模较小的项目，竣工后一次结算的方式；3、按月结算，即每个月结算一次；4、双方约定的其他的结算方式。《最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释（一）》第十九条规定，当事人对建设工程的计价标准或者计价方法有约定的，按照约定结算工程价款。因设计变更导致建设工程的工程量或者质量标准发生变化，当事人对该部分工程价款不能协商一致的，可以参照签订建设工程施工合同时当地建设行政主管部门发布的计价方法或者计价标准结算工程价款。

二、施工合同不备案有什么后果

备案不是效力性强制规定，不备案的合同仍可以是有效的合同。备案与否在工程款结算方面有很大影响。

对于经过招投标程序的建设工程施工合同，其在自投标人中标时就已成立。法律并未规定需经登记备案才生效。

这条是国家政府管理部门为了严格管理和监督建设工程合同而采取的行政管理方法。

设立这种备案制度，并不是中标合同必须经过行政部门审查批准才生效，而是确定以经过备案的中标合同作为承包人与发包人双方之间结算工程款的依据。

三、承包合同签订时需要注意哪些

建设工程承包合同是指发包人和承包人为完成特定的建筑安装工程明确相互权利、义务关系的协议。承包人在签订建设工程承包合同时应当注意以下问题：

第一、在签订合同之前，承包人应当对工程的真实性、可靠性及发包人的资信情况尽可能详细的了解，必要时要做详尽的调查。

第二、合同价款应当明确约定。工期、质量、工程造价的约定，是建设工程施工合同最重要的内容。

第三、详细约定工程预付款、进度拨款和竣工结算程序。

第四、建设工程总承包合同应当具体约定发包人、总承包人、分包人相互关系及各自的责任。总包合同应当将各方关系和责任具体化，便于操作，避免纠纷。

第五、明确约定监理工程师等各方管理人员的职责和权限。建设工程在施工过程中，发包人、承包人、监理人参与与生产管理的工程技术人员和管理人员较多，

往往职责和权限不明确或不为他方所知，造成各方不必要的纠纷。

第六、约定违约条款应当注意的情况。应当约定违约金或赔偿金具体的数额和计算方式，要具有可操作行，以防止事后争议。