医疗事故纠纷处理程序有：

（一）向患者或家属做好沟通、解释、解答工作；

（二）及时上报医务部；

（三）医务部调查、了解和沟通，然后组织调解；

（四）请医院医疗安全委员会批准召开院内医疗纠纷技术讨论会；

（五）申请医疗事故技术鉴定或向人民法院起诉。

医疗事故纠纷处理的时限是多久

医疗事故争议起诉处理时效是三年，在这个时间段里面，患者作为受害人都可以起诉。处理医疗事故，经医疗单位和病员及其家属通过自行协商，对医疗事故的确认（即定性）和处理不能达成协议时，应由当地医疗事故技术鉴定委员会进行鉴定之后，由卫生行政部门进行处理。在一般情况下，人民法院受理医疗纠纷案件大多以医疗侵权纠纷受理。因此作为患者及其家属，在发生医疗纠纷后，一定要注意诉讼时效的规定，不仅有利于证据的收集，也可避免因超过诉讼时效而使自己丧失胜诉的权利。

《医疗事故处理条例》第十四条

发生医疗事故的，医疗机构应当按照规定向所在地卫生行政部门报告。

发生下列重大医疗过失行为的，医疗机构应当在12小时内向所在地卫生行政部门报告：

（一）导致患者死亡或者可能为二级以上的医疗事故；

（二）导致3人以上人身损害后果；

（三）国务院卫生行政部门和省、自治区、直辖市人民政府卫生行政部门规定的其他情形。