没有次数限制，农村合作医疗保险每年可以多次报销。但有封顶线。住院报销总额每人每年累计最高可报销40000元。新型农村合作医疗报销办法：一、参合人员的门诊费用按以下规定办理报销：在村卫生室和镇街道卫生院均按25%报销，门诊补偿总额每人每年最高报销150元。二级（含）以上定点医疗机构的门诊医药费用不予报销。二、住院报销按以下规定办理：（一）起付线。一级定点医疗机构100元，起付线以下的医药费用不予报销。二、三级定点医疗机构不设起付线。（二）报销比例。一级定点医疗机构住院不实行分段补偿，符合报销范围内的医药费补偿比例为65%。二、三级定点医疗机构住院实行分段补偿，分为5000元以下（含5000元）、5000元以上至10000元（含10000元）和10000元以上三段（下同）。符合报销范围内的医药费按以下比例报销：二级定点医疗机构5000元以下的部分按50%的比例报销，5000元至10000元的部分按55%的比例报销，10000元以上的部分按60%的比例报销；三级定点医疗机构5000元以下的部分按35%的比例报销，5000元至10000元的部分按40%的比例报销，10000元以上的部分按照45%的比例报销。一级定点医疗机构包括镇街道卫生院和区级专科医疗机构，二级定点医疗机构包括区级综合医院和市级专科医疗机构，三级定点医疗机构包括市级及市级以上综合医院、市级以上专科医疗机构。执行省内新农合定点医疗机构互认制度，在省内其它县级以上卫生行政部门确认的新农合定点医疗机构治疗的，按本地规定的同级别定点医疗机构补偿比例报销。（三）封顶线。住院报销总额每人每年累计最高可报销40000元。

相关法律规定《中华人民共和国社会保险法》