离婚农村自建房可以通过协商确定权属，协商不成的可以提起诉讼确定房屋所有权归属。

农村自建房尚未取得所有权或者尚未取得完全所有权的房屋，所以具体归谁要协商或诉讼，当事人就房屋取得完全所有权后，有争议的，可以另行向人民法院提起诉讼。

离婚时双方对尚未取得所有权或者尚未取得完全所有权的房屋有争议且协商不成的，人民法院不宜判决房屋所有权的归属，应当根据实际情况判决由当事人使用。

农村自建房离婚协议上给妻子有没有效

农村自建房离婚是否算为财产分为以下几种情况：

1、如果是父母、夫妻共同出资的自建房，房产属父母、夫妻按照出资比例共同所有；

2、如果是父母单独出资的自建房，房产属父母，离婚时不能分割财产；

3、如果是夫妻单独出资的自建房，房产属夫妻，离婚时一人一半。

根据相关法律规定，离婚时，夫妻的共同财产由双方协议处理；协议不成时，由人民法院根据财产的具体情况，照顾子女和女方权益的原则判决。

《中华人民共和国民法典》

第一千零八十七条离婚时，夫妻的共同财产由双方协议处理；协议不成的，由人民法院根据财产的具体情况，按照照顾子女、女方和无过错方权益的原则判决。

对夫或者妻在家庭土地承包经营中享有的权益等，应当依法予以保护。