工程索赔证据的提交方法：

1、提交索赔证据的主体是提出索赔的施工单位。中国现行法律规定谁主张民事举证责任，谁举证，提出索赔的一方有责任提供证据证明索赔；

2、索赔证据的提交应在规定期限内完成。施工单位向对方申请索赔时，应当在施工合同约定的期限内提交证据。

索赔未经合同另一方同意，需要通过诉讼或仲裁解决的，应当在规定的举证期限内进行。

工程索赔过时效如何处理

1、工程索赔过了诉讼时效的，当事人可能协商处理，如果协商不成的，仍然可以向法院起诉，但被告人对诉讼时效有辩护权，原告可能会败诉。

2、法律规定：《中华人民共和国民法典》

第一百九十二条诉讼时效期间届满的，义务人可以提出不履行义务的抗辩。

诉讼时效期间届满后，义务人同意履行的，不得以诉讼时效期间届满为由抗辩；义务人已经自愿履行的，不得请求返还。

第一百九十三条人民法院不得主动适用诉讼时效的规定。

《中华人民共和国民法典》第八百九十二条保管人应当妥善保管保管物。

当事人可以约定保管场所或者方法。除紧急情况或者为维护寄存人利益外，不得擅自改变保管场所或者方法。