在认定这类案件性质时，需要注意以下两个问题：

1．聚众冲击国家机关罪与妨害公务罪的界限。区别主要在于行为对象和行为方式不同，聚众冲击国家机关罪的对象是国家机关，限于聚众冲击的方式；而妨害公务罪的对象是正在依法执行职务的国家机关工作人员，不限于聚众的方式。从实质上讲，聚众冲击国家机关罪妨害的是国家机关的工作秩序，而妨碍公务罪所针对的是国家机关工作人员的具体职务活动。

2．聚众冲击国家机关罪与聚众扰乱社会秩序罪的界限。区别在于：

（1）行为对象有所不同，本罪的对象限于国家机关，而聚众扰乱社会秩序罪的对象还包括国家机关以外的单位；

（2）行为方式有所不同，本罪是聚众冲击；而聚众扰乱社会秩序罪是聚众扰乱。

根据刑法第290条的规定，犯本罪的，对首要分子，处5年以上10年以下有期徒刑；对其他积极参加的，处5年以下有期徒刑、拘役、管制或者剥夺政治权利。

一、聚众扰乱社会秩序罪的认定

(一)本罪与违反治安管理行为的界限

两者在表现形式上可能是相同的，都是扰乱了国家机关、团体、事业单位的秩序，致使工作、生产、营业、教学、科研不能正常进行。两者的主要区别是情节是否严重，是否使国家和社会遭受严重损失。如尚未造成严重损失的，是一般违反治安管理行为，应给予治安管理处罚。

(二)本罪同妨害公务罪的界限

（1）前者侵害的对象是国家机关、企事业单位和人民团体；后者侵害的对象是特定的国家工作人员。

（2）前者是聚众进行；后者可以是单个人进行。

（3）前者不限于采用暴力、威胁的方法；后者采用暴力、威胁的方法。

(三)本罪与聚众冲击国家机关罪的界限

聚众冲击国家机关的行为原本属于扰乱社会秩序的行为的一种，本法鉴于国家机关正常活动对于维护社会稳定的重要性，将其单独规定为一罪。两罪的犯罪客体不同。本罪客体是企事业单位、社会团体的正常活动秩序。聚众冲击国家机关罪的客体是国家机关的正常活动；两罪的犯罪对象不同，聚众冲击国家机关的犯罪对象仅限于各级各类国家机关，本罪的犯罪对象是国家机关以外的其他企事业单位、社会团体。

(四)与聚众扰乱公共场所、交通秩序罪的界限

本罪与上述两罪的主体、客观方面均十分相似，主要区别在于上述两罪发生在车站、码头、民用航空站、商场、公园等公共场所，破坏的是公共场所的秩序；本罪发生在企事业单位、社会团体所在地，破坏的是这些单位的工作、生产、教学、科研秩序。

二、聚众冲击军事禁区罪既遂会被追究什么刑事责任

聚众冲击军事禁区罪既遂的刑事责任是：犯本罪的，对首要分子，处五年以上十年以下有期徒刑；其他积极参加的，处五年以下有期徒刑、拘役、管制或者剥夺政治权利。

本罪只追究聚众冲击军事禁区的首要分子和积极参加者的刑事责任，而不追究一般参与者。首要分子，是指在聚众冲击军事禁区犯罪活动中，起组织、策划、指挥作用的犯罪分子；积极参加的，是指主动参加冲击军事禁区犯罪活动的，在实施犯罪申起了重要作用或者有其他犯罪行为的等。

对聚众冲击军事禁区的首要分子，在判处主刑的同时，一般也应附加剥夺政治权利。