可以做医疗事故鉴定的部门有：

1、卫生行政部门：卫生行政部门接到医疗机构关于重大医疗过失行为的报告或者医疗事故争议当事人要求处理医疗事故争议的申请后，对需要进行医疗事故技术鉴定的，应当交由负责医疗事故技术鉴定工作的医学会组织鉴定；

2、负责医疗事故技术鉴定工作的医学会组织：医患双方协商解决医疗事故争议，需要进行医疗事故技术鉴定的，由双方当事人共同委托负责医疗事故技术鉴定工作的医学会组织鉴定；

3、地方医学会负责组织：设区的市级地方医学会和省、自治区、直辖市直接管辖的县（市）地方医学会负责组织首次医疗事故技术鉴定工作；省、自治区、直辖市地方医学会负责组织再次鉴定工作；

4、中华医学会：必要时，中华医学会可以组织疑难、复杂并在全国有重大影响的医疗事故争议的技术鉴定工作。

医疗事故鉴定的鉴定部门是医学会。具体是：设区的市级地方医学会和省、自治区、直辖市直接管辖的县（市）地方医学会负责组织首次医疗事故技术鉴定工作。省、自治区、直辖市地方医学会负责组织再次鉴定工作。

一、医疗鉴定申请流程

医疗鉴定的申请流程如下：

1、当事人自知道或者应当知道利益受到损害之日起一年内向卫生行政部门提出听证鉴定申请。依据《医疗事故处理条例》第三十七条发生医疗事故争议，当事人申请卫生行政部门处理的，应当提出书面申请。申请书应当载明申请人的基本情况、有关事实、具体请求及理由等。当事人自知道或者应当知道其身体健康受到损害之日起1年内，可以向卫生行政部门提出医疗事故争议处理申请。

2、卫生行政部门十日内做出是否受理的审查。

2、四十五日内作出医疗鉴定报告。依据《医疗事故处理条例》第二十九条规定，负责组织医疗事故技术鉴定工作的医学会应当自接到当事人提交的有关医疗事故技术鉴定的材料、书面陈述及答辩之日起45日内组织鉴定并出具医疗事故技术鉴定书。负责组织医疗事故技术鉴定工作的医学会可以向双方当事人调查取证。

二、申请医疗鉴定要多少钱

医疗鉴定费用，鉴定的内容不同收费也不同，但医疗鉴定费最低为500元。依据《医疗事故处理条例》第三十四条规定，医疗事故技术鉴定，可以收取鉴定费用。经鉴定，属于医疗事故的，鉴定费用由医疗机构支付；不属于医疗事故的，鉴定费用由提出医疗事故处理申请的一方支付。鉴定费用标准由省、自治区、直辖市人民政府价格主管部门会同同级财政部门、卫生行政部门规定。《司法鉴定收费项目和收费标准基准价（试行）》规定，死后二十四小时以内验尸含拍照、录像收费500元；如果是死后超过二十小时验尸，收费1000元，高度腐败尸体加收百分之五十费用；如果死后验尸需要解剖尸体，确定死亡原因、死亡时间、生前伤死后伤、致死物鉴定的收费2500元等。