一、上级检察院能否立案侦查下级检察院管辖案件

1、可以。上下级人民检察院管辖案件的规定如下：

(1)上级人民检察院在必要的时候，可以直接立案侦查或者组织、指挥、参与侦查下级人民检察院管辖的案件。

(2)下级人民检察院认为案情重大、复杂，需要由上级人民检察院立案侦查的案件，可以请求移送上级人民检察院立案侦查。

2、法律依据：《人民检察院刑事诉讼规则》第十六条

二、检察院立案必须经过的程序

检察机关立案是人民检察院办理刑事案件的第一道程序。根据刑事诉讼法第八十三条规定：“公安机关或者人民检察院发现犯罪事实或者犯罪嫌疑人，应当按照管辖范围，立案侦查。”

为确保立案质量，检察机关必须严格依法定程序立案。

检察机关刑事立案的程序是：

首先，由承办案件的人员制作《立案请示报告》;其次，经部门负责人或者主办检察官审查;再次，由部门负责组织讨论同意;最后，由部门负责人或主办检察官报请检察长批准。

重大、复杂或者疑难的案件，还要由检察长提请检察委员会讨论决定。经过批准或决定以后，由承办人填写《立案决定书》，人民检察院据此正式对案件展开侦查。

《立案决定书》要载明犯罪嫌疑人的姓名、涉嫌的罪名、立案的法律依据、立案的机关、立案的时间等内容，立案决定书上要有检察长签字印章。

《立案决定书》是人民检察院依法对案件正式侦查的依据，是对犯罪嫌疑人采取各种侦查措施和强制措施的前提条件，必须认真制作。