撤销案件只有公安机关在侦查过程中，发现不应对犯罪嫌疑人追究刑事责任的，才应撤销案件，而如果涉嫌强奸，只是证据不足，这种情况是很难撤销案件的。

《刑事诉讼法》第一百三十条

“在侦查过程中，发现不应对犯罪嫌疑人追究刑事责任的，应当撤销案件；

犯罪嫌疑人已被逮捕的，应当立即释放，发给释放证明，并且通知原批准逮捕的人民检察院。”

据此，撤销案件只有公安机关在侦查过程中，发现不应对犯罪嫌疑人追究刑事责任的，才应撤销案件，而如果涉嫌强奸，只是证据不足，这种情况是很难撤销案件的。