公积金还贷款是从每个月的公积金里面扣。一般情况下在缴纳公积金的时候，个人缴费金额每月都会直接进入公积金的账户余额。在申请了公积金贷款之后，还款金额是直接从公积金账户余额里面进行抵扣的，当公积金账户余额不足以抵扣贷款金额时，剩余金额部分就需要用户将资金转入房贷还款银行卡，系统会自动进行扣款的。

住房公积金贷款提前还款注意事项：

1、公积金贷款提前还款需要满足申请人还款时间已经满一年的条件；

2、申请人当前并没有处于逾期还款的状态中；

3、公积金贷款提前还款行为一年只限进行一次；

4、对于提前部分还贷的情况，每次提前还贷金额不得低于1万元，并且要不少于12个月的贷款本息金额数；

5、公积金贷款提前还款不存在交手续费或者违约金的情况。

法律依据：《住房公积金管理条例》第二十六条

缴存住房公积金的职工，在购买、建造、翻建、大修自住住房时，可以向住房公积金管理中心申请住房公积金贷款。住房公积金管理中心应当自受理申请之日起15日内作出准予贷款或者不准贷款的决定，并通知申请人；准予贷款的，由受委托银行办理贷款手续。住房公积金贷款的风险，由住房公积金管理中心承担。

住房公积金还贷款流程

首先呢，公积金提前还贷的方式分为提前全部还贷、提前部分还贷两种，我们先来看一下公积金提前还款的流程。

一次性归还本息方式

（一）申请人可通过拨打公积金管理中心热线查询自己的剩余尾款金额，并预约提前还款的金额；

（二）首先还款人申请提前还款，填写《住房公积金管理中心住房公积金贷款提前还清贷款申请书》或《住房公积金管理中心住房公积金贷款提前偿还部分贷款申请书》并签章和提供所需资料；

（三）受委托银行审批；

（四）公积金管理中心审批；

（五）去银行偿还贷款本息；

（六）将提前还款表送至公积金中心留档。

归还部分贷款本金方式

（一）借款人拨打公积金管理热线，根据语音提示输入您打算提前还款的数额并进行预约还款

（二）还款人申请提前还款，填写《住房公积金管理中心住房公积金贷款提前还清贷款申请书》或《住房公积金管理中心住房公积金贷款提前偿还部分贷款申请书》并签章和提供所需资料；

（三）确定提前还款还贷金额和提前还贷的日期；

（四）受委托银行审批；

（五）公积金管理中心审批；

（六）去银行偿还部分贷款本金；

（七）将提前还款表送至公积金中心留档。