施工合同跟备案合同是一样的;根据《房屋建筑和市政基础设施工程施工招投标管理办法》第四十六条规定：

招标人和中标人应当自中标通知书发出之日起30日内，按照招标文件和中标人的投标文件订立书面合同;招标人和中标人不得再行订立背离合同实质性内容的其他协议。

订立书面合同后7日内，中标人应当将合同送工程所在地的县级以上地方人民政府建设行政主管部门备案。

当事人就同一建设工程另行订立的建设工程施工合同与经过备案的中标合同实质性内容不一致的，应当以备案的中标合同作为结算工程价款的根据。因为合同备案后具有法律效应，所以备案合同与施工合同内容不一致，需要以备案合同为准来进行结算。

一、如果双方签订的施工合同未经备案是否发生法律效力

如果双方签订的施工合同未经备案是会发生法律效力，现在已经取消了建筑施工合同的备案。

《房屋建筑和市政基础设施工程施工招标投标管理办法》

第四十六条

招标人和中标人应当自中标通知书发出之日起30日内，按照招标文件和中标人的投标文件订立书面合同；招标人和中标人不得再行订立背离合同实质性内容的其他协议。

中标人不与招标人订立合同的，投标保证金不予退还并取消其中标资格，给招标人造成的损失超过投标保证金数额的，应当对超过部分予以赔偿；没有提交投标保证金的，应当对招标人的损失承担赔偿责任

招标人无正当理由不与中标人签订合同，给中标人造成损失的，招标人应当给予赔偿。

二、未经备案的施工合同是否有效

施工合同的法律效力跟备案是没有直接关系的，施工合同备案已经取消。

住房城乡建设部关于修改《房屋建筑和市政基础设施工程施工招标投标管理办法》的决定

1、删去第四十七条第一款中的“订立书面合同后7日内，中标人应当将合同送工程所在地的县级以上地方人民政府建设行政主管部门备案”。

2、删去第五十三条中的“招标人拒不改正的，不得颁发施工许可证”。