对于是同一犯罪的，正常进行诉讼，犯罪金额累计计算；对于是另种犯罪的，依法重新计算羁押期限；其次，会同原有罪名，予以数罪并罚。《刑法》第七十条规定：“判决宣告以后，刑罚执行完毕以前，发现被判刑的犯罪分子在判决宣告以前还有其他罪没有判决的，应当对新发现的罪作出判决，把前后两个判决所判处的刑罚，依照本法第六十九条的规定，决定执行的刑罚。已经执行的刑期，应当计算在新判决决定的刑期以内。”

一、补充侦查的情况

人民检察院审查案件，对于需要补充侦查的，可以退回公安机关补充侦查，也可以自行侦查。

对于补充侦查的案件，应当在一个月以内补充侦查完毕。补充侦查以二次为限。补充侦查完毕移送人民检察院后，人民检察院重新计算审查起诉期限。

由《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国刑事诉讼法〉的解释》第二百二十三条、第二百二十二条第二款规定不难看出，即使法院同意检察机关提出的一次或者两次延期审理的建议，申请延长审限获得上一级法院批准，其程序仍稍显冗长、繁琐。参考《刑事诉讼法》第一百五十八条关于侦查机关重新计算侦查羁押期限的规定、第一百七十一条第三款关于补充侦查后检察院重新计算审查起诉期限的规定、第二百零二条第二款补充侦查后法院重新计算审理期限的规定，还宜规定：人民检察院补充起诉的案件，移送人民法院后，人民法院重新计算审理期限。如此则可简化诉讼程序，提高诉讼效率，一定程度上可以减少先行判决的情况发生，且对被告人的权益保护也是有利的。

在司法实践中，对于侦查过程中存在新的犯罪事实的，是需要按照法律规定的程序来对相关犯罪事实来进行处理的，如果对相关情况的认定存在异议的，或者发现犯罪事实不能认定的，还需要按照法定的程序来进行处罚，具体情况应当结合实际而定。