当需要做商业秘密的认定时，首先提出主体是否有限制，当需要做商业秘密的认定时，主要为保密纠纷，此时需要做商业秘密的认定。

要识别商业秘密，企业可以直接利用商业秘密的要素；价值性、实用性、新颖性、保密性进行评价。企业应该分析某一地区的行业情况，从而正确估计竞争地位，从有利于企业的角度确定商业秘密，而不是简单地从法律的角度认定商业秘密。民事诉讼证据制度的基本原则是谁主张谁提供证据。根据《司法鉴定程序通则》，司法鉴定机构应当要求委托人出具委托书，提供委托人身份证明，并提供委托鉴定所需的鉴定材料。委托人委托他人代理的，应当提交委托书本通则所称鉴定材料，包括检验材料和鉴定材料。试验材料是指与鉴定事项有关的生物和非生物试验材料；鉴定数据是指存在于各种载体上的与鉴定事项有关的记录。”因此，商业秘密的主体应当是原告、被告或者与本案有利害关系的第三人，或者由法院主动认定。鉴定意见可以作为一种证据提交法院。