认定当事人所持有的专利为无效的程序如下：

1、申请人向国务院专利行政部门提出宣告该专利权无效的申请；

2、国务院专利行政部门依法及时审查和作出决定，并通知请求人和专利权人；

3、国务院专利行政部门依法作出宣告专利权无效的决定，并进行登记和公告。

一、实用新型专利的保护期限是怎么去规定的

实用新型专利的保护期限是十年，自申请日起算。

《专利法》第四十二条规定，发明专利权的期限为二十年，实用新型专利权的期限为十年，外观设计专利权的期限为十五年，均自申请日起计算。

自发明专利申请日起满四年，且自实质审查请求之日起满三年后授予发明专利权的，国务院专利行政部门应专利权人的请求，就发明专利在授权过程中的不合理延迟给予专利权期限补偿，但由申请人引起的不合理延迟除外。

为补偿新药上市审评审批占用的时间，对在中国获得上市许可的新药相关发明专利，国务院专利行政部门应专利权人的请求给予专利权期限补偿。补偿期限不超过五年，新药批准上市后总有效专利权期限不超过十四年。

二、发明专利期限从什么时候算

发明专利期限从申请日起计算。发明专利权的期限为二十年。自发明专利申请日起满四年，且自实质审查请求之日起满三年后授予发明专利权的，国务院专利行政部门应专利权人的请求，就发明专利在授权过程中的不合理延迟给予专利权期限补偿，但由申请人引起的不合理延迟除外。

三、专利申请有哪些流程

专利申请有以下流程如下：

1、确定发明创造的内容是否属于能够申请专利的内容以及可申请专利的类型。

2、签订代理委托协议。

3、技术交底。

4、确定申请方案。

5、准备申请文件。

6、审查。

7、审查结论。

《专利法》第三十四条规定，国务院专利行政部门收到发明专利申请后，经初步审查认为符合本法要求的，自申请日起满十八个月，即行公布。国务院专利行政部门能够根据申请人的请求早日公布其申请。

第四十条规定，实用新型和外观设计专利申请经初步审查没有发现驳回理由的，由国务院专利行政部门作出授予实用新型专利权或者外观设计专利权的决定，发给相应的专利证书，同时予以登记和公告。实用新型专利权和外观设计专利权自公告之日起生效。