公司自治，一是指设立上的自由。公司设立的准则主义意味着凡符合法定公司设立要件的团体，一经登记注册即取得法人资格，国家就认可其合法地位，无需满足其它条件、履行其他程序。

二是指公司经营的自由。公司根据经营判断原则进行经营管理，不触犯刑法不受公权力的直接干预。公司的董事、经理等高级管理人员作为公司意思的代表人根据公司、股东利益最大化的目的决定公司日常的生产、经营事宜。

三是指公司股东作为最终的所有者可以根据其持有的股份通过行使投票权形成股东会决议来行使所有者的资产收益、重大决策和选择管理者的权利。

四是指公司可以通过公司章程的制定自行作出公司内部个性化的制度安排。新修订的公司法全面贯彻了实现公司自治的基本理念，使得新公司法成为鼓励制度创新、促进公司自治的商事法律。